肛瘘术后出现小红疙瘩可能是术后并发症，如皮脂腺囊肿、血栓性外痔等，需要及时处理以防止病情恶化。

肛瘘术中可能会损伤周围组织，导致局部血液循环受阻，从而引起血栓性外痔。此外，术后长期存在排便困难等问题也可能增加患皮脂腺囊肿的风险。这两种疾病都可能导致皮肤表面出现小红疙瘩，因此需要专业医生评估和治疗。

患者还可能出现疼痛、瘙痒等症状，可能与伤口愈合不良有关。

在术后恢复期间，患者应注意保持局部清洁干燥，避免剧烈运动，以免影响伤口愈合。